Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM187BQ17R55 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms