Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FXNQ16595 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FXNQ16595 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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