Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ASIC2Q16515 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASIC2Q16515 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms