Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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