Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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