Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms