Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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