Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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