Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP8Q14114 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms