Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC1Q13547 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms