Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXE3Q13461 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXE3Q13461 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXE3Q13461 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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