Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPPAQ13219 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPPAQ13219 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms