Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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