Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms