Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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GRIK3Q13003 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK3Q13003 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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