Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms