Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms