Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms