Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A1P68400 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms