Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms