Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPNP63162 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms