Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-24P63145 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms