Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms