Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJA9P57773 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJA9P57773 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA9P57773 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms