Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB25P57735 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB25P57735 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB25P57735 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB25P57735 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB25P57735 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms