Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms