Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK1P57059 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK1P57059 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK1P57059 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms