Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN17P56750 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN17P56750 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN17P56750 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN17P56750 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN17P56750 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN17P56750 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN17P56750 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN17P56750 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms