Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms