Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP7P55210 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP7P55210 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms