Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms