Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSNK1A1P48729 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms