Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4P46934 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms