Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms