Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MLH1P40692 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MLH1P40692 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MLH1P40692 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MLH1P40692 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MLH1P40692 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MLH1P40692 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MLH1P40692 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MLH1P40692 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MLH1P40692 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MLH1P40692 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MLH1P40692 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms