Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms