Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA7P36544 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms