Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms