Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOXD13P35453 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms