Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms