Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3AP31941 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms