Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD10P28358 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms