Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms