Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT1P26358 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms