Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF4P23510 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF4P23510 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms