Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPREP23469 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPREP23469 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPREP23469 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPREP23469 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPREP23469 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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