Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms