Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCLS1P14317 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms