Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF35P13682 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms