Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL2P13500 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL2P13500 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms